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AI Biology R&D Enters the 'Operating System Era': Xu Jinbo's Team Officially Opens MoleculeOS

AI生物研发进入“操作系统时代”,许锦波团队MoleculeOS正式开放

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Date
2026-07-10
Instrument
other
Cited by
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This document reports the official launch of MoleculeOS, an AI-native biological economy operating system from Xu Jinbo's team, which integrates AI models to orchestrate the entire biological R&D process, moving beyond single-point tools to a unified system for molecule discovery and design.
Full text · 原文 2,451 字
允中 发自 凹非寺<br> 量子位 | 公众号 QbitAI<br> AI生物研发,正在迎来它的“Windows时刻”。<br> 过去,AI是帮科学家做结构预测、抗体设计的“单点工具”;而现在,它正演变为统领全局的“操作系统”。<br> 7月2日,在2026上海国投前沿论坛上,分子之心创始人许锦波教授正式面向产业界开放其自研的AI原生生物经济操作系统——MoleculeOS(MOS)。<br> 这不仅是一个系统的发布,更释放出一个明确的信号:<br> 生物领域的研发基础设施,正在被重新定义。<br> 在这里,AI的角色从生物规律的“预测者”,蜕变为研发流程的“组织者”。<br> 传统的“筛选试错”式的分子发现正步入历史,一个更具确定性的“分子创造”时代,正由这款AI原生操作系统正式开启。<br> 试用入口:https://mos.moleculemind.com/login<br> 从工具智能到系统智能:重构AI制药与生物制造的研发模式<br> 过去几年,AI在蛋白质结构预测、抗体设计、分子生成和功能优化等方向不断突破,证明了算法理解生命科学的巨大潜力。<br> 但在真实产业场景中,模型突破并不等于研发效率跃迁。<br> 一个典型的大分子研发任务,往往涉及靶点分析、序列建模、结构预测、结合界面判断、突变设计、亲和力评估、稳定性评估、可开发性分析和实验验证等众多环节。<br> 过去,这些环节分散在不同工具和团队之间,研发人员需要手动调度流程,结果也难以统一沉淀。<br> 传统“工具栈+人工调度”模式,正成为AI技术向产业价值转化的核心瓶颈。<br> MoleculeOS是一个面向生物研发的AI操作系统。<br> 它基于分子之心自研的AI模型体系,以项目目标为入口,AI通过自主理解使用者的生物学意图,自动拆解任务、统一调度系列模型、执行结构预测、分子设计等任务,经过多维度科学评估给出决策建议,并沉淀可追踪、可复盘的研发链路。<br> 试用入口:https://mos.moleculemind.com/login<br> MoleculeOS的核心变化,是把“研发意图”作为系统入口。<br> 研究人员不再只是上传一个序列或结构文件执行单一预测任务,而是直接提出目标:例如提升抗体亲和力、或针对特定靶点生成候选分子。<br> 系统会围绕目标自动拆解任务,在统一的生物物理上下文中调度模型,完成从结构预测到推荐候选分子及下一步决策建议的系统性任务。<br> 这意味着,AI不再只是执行单步计算,而是开始组织完整研发流程。<br> 过去高度依赖个人经验的判断过程,也可以被系统记录为可追踪、可复盘、可复用的研发资产。<br> 对于企业而言,这种变化不仅是效率提升,更意味着研发体系开始具备更强的标准化、协同化和可扩展能力。<br> 更重要的是,MoleculeOS将每一次从研发意图到最终结论的完整链路,自动沉淀为结构化研发资产。<br> 当团队启动下一个项目时,历史项目的计算参数、筛选逻辑和决策依据都可以被调用——<br> 研发不再是从零开始的重复劳动,而是在一套持续积累的体系中加速。<br> 这正是操作系统区别于工具集的根本所在。<br> 自研模型集群构筑底层能力:从理解生命规律到设计功能分子<br> MoleculeOS的底层能力,来自分子之心在蛋白质基础大模型、蛋白质结构预测和分子设计方向的长期积累。<br> 围绕“序列—结构—功能—进化—相互作用—生成设计”,分子之心团队构建了覆盖全流程的自研模型体系,包括:<br> 多模态蛋白质基础大模型NewOrigin(达尔文)<br> 全原子大分子复合物结构预测模型(MMFold)<br> 面向纳米抗体、酶和功能蛋白的生成式设计模型(MMDesign)<br> 在结构预测方向,分子之心自研的全原子大分子结构预测模型MMFold,已在FoldBench基准测试中针对172个抗体–抗原界面实现了68.6%预测成功率,相较AlphaFold3等国际主流模型显著领先。<br> 在分子设计方向,其抗体从头设计平台在12个靶点中,实现了在每个靶点仅测试不超过50个候选分子的极低通量条件下,靶点成功率超过90%,将AI大分子设计从依赖大规模随机筛选,推向“低通量、高命中率、可编程设计”的新范式。<br> 更重要的是,在MoleculeOS中,这些模型并非孤立工具,而是被统一组织到一个AI原生的操作系统中,实现以最终的研发目标为导向,综合分析序列适应性、结构稳定性、进化保守性、亲和力变化和可开发性等指标,为每个候选分子提供清晰的判断依据。<br> 从技术验证到产业应用:低门槛应用推动规模化价值落地<br> “对于AI生物技术而言,模型指标固然重要,但真正决定产业价值的,是能否在真实研发中稳定产生有效候选、缩短周期并降低试错成本。”分子之心创始人许锦波教授表示。<br> 许锦波是全球蛋白质结构预测领域的开创者之一,早在2016年就提出RaptorX-Contact方法,率先证明深度学习可以显著提升蛋白质结构预测精度,被业界视为AlphaFold等预测模型的重要方法学开创者。<br> 他认为,当前AI生物技术竞争的核心,已经从单点模型能力,走向系统级研发基础设施。<br> 一个明确的信号正在释放:AI大分子设计的竞争,不只是“生成更多分子”,而是“更准确地生成值得实验验证的分子”。<br> 在本次面向产业界开放前,MoleculeOS已作为分子之心内部工程化底座,支撑多项创新药和生物制造项目。<br> 在一个免疫检查点抗体优化项目中,研究人员只需输入靶点和研发目标,系统即可自动完成候选生成、结构预测、多维评估和推荐。<br> 传统流程中需要多名研究人员跨工具协作、耗时数周的工作,在MoleculeOS中可压缩至数小时。<br> 完成计算后,项目结果可一键分享至湿实验团队,包含完整计算链路与可视化分析——让从干实验到湿实验的决策依据不再依赖二次转述。<br> 此次MoleculeOS正式开放,也意味着分子之心决心把内部验证过的AI原生操作系统推向更广泛的产业场景。<br> 创新药、生物制造、合成生物学等领域的团队,可以围绕自身需求,低门槛获得MoleculeOS的系统能力。<br> 分子之心表示,未来将持续开放更多模型能力与智能研发模块,与产业伙伴共同探索AI原生操作系统赋能研发的新范式。